由國科會主任委員與主管科技之政務委員召集，協同相關部會署主管科技之副首長、學者專家及產業界人士成立本國家型科技計畫「指導小組」。指導小組之執掌如下：
(1) 核定國家型科技計畫之政策方針及工作計畫(含規劃小組及計畫辦公室運作計畫)。
(2) 核定諮議小組成員。
(3) 複審總體規劃報告。（總體規劃報告初審由諮議小組負責）
(4) 審議國家型科技計畫預算。
(5) 聽取年度執行及檢討報告。
生技製藥國家型科技計畫第三期指導小組成員如下：
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1
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召集人
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陳建仁
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主任委員
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國科會
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2
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召集人
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林逢慶
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政務委員
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行政院科技顧問組
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3
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委員
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施顏祥
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次長
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經濟部
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4
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委員
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陳再晉
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副署長
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衛生署
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5
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委員
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戴謙
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副主任委員
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國科會
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6
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委員
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汪庭安
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執行秘書
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行政院科技顧問組
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7
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委員
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陳紹琛
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主任
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美國FDA藥物審查協會
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8
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委員
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陳垣崇
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所長（院士）
|
中研院生醫所
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9
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委員
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陳正
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總經理
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健亞生物科技公司
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10
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委員
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李國雄
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教授（院士）
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美國北卡大學
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11
|
委員
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洪明奇
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教授（院士）
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美國德州大學安德森癌症中心
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12
|
委員
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何英剛
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副院長（院士）
|
國家衛生研究院
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13
|
委員
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賴明詔
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副院長（院士）
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中央研究院
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14
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委員
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許明珠
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總經理
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太景科技公司
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生技製藥國家型科技計畫第二期指導小組成員如下：
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1
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召集人
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吳茂昆
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主任委員
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國科會
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2
|
召集人
|
林逢慶
|
政務委員
|
行政院科技顧問組
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|
3
|
委員
|
施顏祥
|
次長
|
經濟部
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4
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委員
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楊漢湶
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副署長
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衛生署
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5
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委員
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廖俊臣
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副主任委員
|
國科會
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6
|
委員
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汪庭安
|
執行秘書
|
行政院科技顧問組
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7
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委員
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孔繁健
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海外科技顧問
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行政院科技顧問組
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8
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委員
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陳垣崇
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所長(院士)
|
中研院生醫所
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9
|
委員
|
賴明詔
|
副院長(院士)
|
中央研究院
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10
|
委員
|
李國雄
|
教授(院士)
|
美國北卡大學
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11
|
委員
|
何英剛
|
教授(院士)
|
美國密西西比大學(中研院)
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12
|
委員
|
洪明奇
|
教授(院士)
|
美國德州大學安德森癌症中心
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13
|
委員
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陳紹琛
|
主任
|
美國FDA藥物審查協會
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14
|
委員
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許明珠
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總經理
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太景科技公司
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15
|
委員
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陳 正
|
總經理
|
健亞生物科技公司
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M-W